SS2023, 2 SWS, 3 LP, Veranstaltungs-Nr. 061182 - Kickoff Dienstag 11.4.2023 16-18 GII, 520
Motivation: Jüngste Fortschritte von Sequenzierungstechnologien haben zu einer Blüte genomischer Ressourcen geführt, was zum Beispiel durch großangelegte Genomprojekte für Wirbeltiere (Bird 10K, Bat 1K) veranschaulichtwird. In naher Zukunft könnten Referenzgenome fast aller Arten verfügbar sein. Aber was können wir aus dem Genom eines einzelnen Individuums über die genetische Diversität der gesamten Spezies lernen? Um das zu Beantworten ist Ziel des Projekts, zu verstehen welche genetische Vielfalt in Wirbeltierreferenz-genomen erfasst ist.
Ansatz: Teilnehmende werden ein einzelnes, selbstgewähltes Speziengenom untersuchen. Anschließend werden die einzelnen Genomergebnisse über eine Platform zusammengetragen und gemeinsam ausgewertet. Ziel ist es dabei möglichst viele (“Swarm”) Genome in die Analyse aufzunehmen.
Kompetenzen
Vorhaben: Das Projekt ist vollständig computerbasiert und kann online durchgeführt werden. Inhalte werden dabei Bereiche der Populationsgenetik, molekularen Evolution und des Data mining von biologischen Daten abdecken. Das Modul wird eingeleitet mit einer Einführung in die Genomsequenzierung und relevantepopulationsgenetische Methoden. Anschließend werden die Teilnehmenden unter Anleitung das Genom einer selbstgewählten Spezies analysieren. Erzielte Ergebnisse der einzelnen Spezien werden dann auf einer Platform zusammengeführt und ausgewertet.
